Résumé :

L’histoire se passe plusieurs années après les aventures de Yugi Mutô. Sur une petite île a été créer une école où la future élite des duellistes est formée : elle se nomme Duel Académie. Les élèves sont divisés en trois rangs : les « Obelisk Bleus », qui sont les meilleurs élèves de l’école ; les « Râ Jaunes », qui ont réussi brillamment leur examen d’entrée ; les « Osiris Rouges », qui sont constamment menacés d’être expulsés de l’école. Judai Yuki est un élève « rouge ». Cependant, il n’est pas comme les autres élèves de son rang : il est très doué en duel. Il possède toutefois une certaine habilité à dire tout haut ce que tout le monde pense tout bas, ce qui a régulièrement le don d’énerver ses professeurs. Mais cela lui est égal : son ambition, c’est de devenir le nouveau « King of Duel », et ainsi d’arriver à égaler son modèle Yugi Mutô.